Da bi dijete sigurno primilo vakcinu, mora biti zdravo. Djeca koja imaju znakove akutne bolesti, naročito organa za disanje, ne smiju dobiti vakcinu.  

Postoji precizna lista dugotrajnih (hroničnih) bolesti koje narušavaju sposobnost djeteta da ostvari adekvatnu imunološku reakciju, pa obične vakcine mogu biti vrlo opasne za male pacijente.

Pedijatri znaju koja su to oboljenja, ali treba naglasiti da se većina njih može izliječiti pa se vakcinacija može obaviti nakon ozdravljenja.

Postoje situacije kada je dijete alergično na neku komponentu vakcine, iako na prvi pogled alergija nije u vezi s vakcinom.

Tako djeca i odrasli alergični na jaja ne smiju dobiti standardnu vakcinu protiv gripe, jer se ona "uzgaja" na embrionu pileta (koji je zakačen za žumance).